If the destination for these downloads is another Laserfiche system, you could export as Laserfiche Briefcases, an XML-based format which contains both the files and their metadata.

You can write to the .pdf's custom properties with iTextSharp

using iTextSharp.text.pdf; 

.....

using (PdfReader reader = new PdfReader(fullFileName))
            {
                using (FileStream fs = new FileStream(pdfStamped, FileMode.Create, FileAccess.Write, FileShare.None))
                {
                    using (PdfStamper stamper = new PdfStamper(reader, fs))
                    {
                        Dictionary<String, String> info = reader.Info;
                        foreach (KeyValuePair<string, string> props in properties)
                        {
                            if(info.ContainsKey(props.Key))
                            {
                                info.Remove(props.Key);
                            }
                            info.Add(props.Key, props.Value);
                        }

                        stamper.MoreInfo = info;
                        stamper.Close();
                    }
                }
            }